Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOL3O95236 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms