Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms