Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPM2O94759 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPM2O94759 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms