Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLOT1O75955 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FLOT1O75955 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms