Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms