Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL13O43927 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms