Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms