Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF1O43189 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF1O43189 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms