Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLGNO14967 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLGNO14967 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms