Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QW42 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QW42 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QW42 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QW42 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms