Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms