Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms