Protein–RNA interactions for Protein: A8MYJ7

TTC34, Tetratricopeptide repeat protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC34A8MYJ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTC34A8MYJ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTC34A8MYJ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms