Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KNCNA6PVL3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms