Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A6NL46 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A6NL46 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A6NL46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms