Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23AA6NH52 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms