Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms