Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L4A6NCW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L4A6NCW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms