Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F8A0AVK6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F8A0AVK6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms