Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHOC2Q9UQ13 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHOC2Q9UQ13 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms