Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GOPCQ9HD26 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.4 ms