Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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