Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms