Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RPA4Q13156 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
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