Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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