Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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