Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms