Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms