Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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