Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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