Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NR1H3Q13133 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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