Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RBM42Q9BTD8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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