Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK5Q16478 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms