Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ALX1Q15699 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms