Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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