Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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