Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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