Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms