Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HCN4Q9Y3Q4 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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