Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SH3BP4Q9P0V3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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