| SEMA3A | Q14563 | SNORA31.22-201 | ENST00000517204 | 135 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SUB1P1-201 | ENST00000524415 | 382 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068587.5-201 | ENST00000528506 | 175 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP000462.3-201 | ENST00000545593 | 330 nt | TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445074.1-201 | ENST00000555362 | 318 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL355836.1-201 | ENST00000555951 | 870 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025043.1-201 | ENST00000558047 | 625 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC020661.2-201 | ENST00000560114 | 134 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL133383.1-201 | ENST00000569292 | 901 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BNIP3P22-201 | ENST00000593399 | 556 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009248.2-201 | ENST00000619826 | 254 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL589994.2-201 | ENST00000621124 | 579 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC034229.5-201 | ENST00000624258 | 185 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068631.1-219 | ENST00000625826 | 668 nt | TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SEPT14P19-202 | ENST00000632397 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRIQK-204 | ENST00000517858 | 1882 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF804B-202 | ENST00000611114 | 3968 nt | TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FIGNL1-203 | ENST00000419119 | 3700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CEP85L-202 | ENST00000368488 | 7118 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IQCG-205 | ENST00000455191 | 1981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF285B-201 | ENST00000561698 | 1767 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CCSER2-201 | ENST00000224756 | 7664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GSTA3-201 | ENST00000211122 | 902 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-179P-201 | ENST00000363350 | 107 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.157-201 | ENST00000363638 | 102 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-48P-201 | ENST00000365559 | 182 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GSTA3-202 | ENST00000370968 | 775 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AKAP14-202 | ENST00000371422 | 412 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-606P-201 | ENST00000384721 | 111 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR23A-201 | ENST00000385245 | 73 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL21P17-201 | ENST00000397467 | 475 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U3.39-201 | ENST00000408569 | 239 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RAB9AP3-201 | ENST00000412737 | 573 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC018630.2-202 | ENST00000422992 | 927 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C1orf195-201 | ENST00000424792 | 255 nt | TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AF124730.1-201 | ENST00000430001 | 327 nt | TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MACC1-AS1-201 | ENST00000439285 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TXNP1-201 | ENST00000441872 | 371 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS3AP46-201 | ENST00000448352 | 682 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RAB9AP1-201 | ENST00000449393 | 573 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-182P-201 | ENST00000459009 | 62 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSPE1P6-201 | ENST00000479457 | 291 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | HMGN1P11-201 | ENST00000508668 | 303 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC087318.1-201 | ENST00000536786 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011611.1-201 | ENST00000552179 | 197 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL442663.2-201 | ENST00000554385 | 511 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PSMA3P-201 | ENST00000555485 | 635 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL157688.1-201 | ENST00000555990 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011939.2-201 | ENST00000567396 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR6076-201 | ENST00000617521 | 113 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U4.6-201 | ENST00000621618 | 127 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RMST_7.1-201 | ENST00000621935 | 268 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL357559.1-201 | ENST00000622228 | 274 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092442.1-201 | ENST00000636216 | 138 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TPTEP1-208 | ENST00000636884 | 213 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MACF1-201 | ENST00000289893 | 19141 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068647.1-201 | ENST00000489539 | 2265 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C5orf42-205 | ENST00000508244 | 11062 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SRP72P2-201 | ENST00000344851 | 1979 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AGR3-201 | ENST00000310398 | 749 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-64P-201 | ENST00000365443 | 163 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RFX3-203 | ENST00000381984 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-701P-201 | ENST00000384059 | 107 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NDUFS5P1-201 | ENST00000405668 | 289 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR1290-201 | ENST00000408735 | 78 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SYF2P2-201 | ENST00000417620 | 583 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSPE1P1-201 | ENST00000421494 | 318 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00368-201 | ENST00000422994 | 650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL353729.1-201 | ENST00000425044 | 720 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO3P46-201 | ENST00000425787 | 232 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012070.1-201 | ENST00000442062 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF4EP3-201 | ENST00000498782 | 656 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC074124.1-201 | ENST00000502368 | 375 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC024022.1-202 | ENST00000508911 | 394 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-327P-201 | ENST00000516270 | 127 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BTF3P12-201 | ENST00000519620 | 469 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006518.2-202 | ENST00000544947 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009803.1-201 | ENST00000551531 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MED28P6-201 | ENST00000558776 | 231 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3921-201 | ENST00000577308 | 85 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC243960.4-201 | ENST00000600532 | 288 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL121992.2-201 | ENST00000606262 | 256 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092636.1-201 | ENST00000608609 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009570.1-201 | ENST00000609599 | 745 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DISC2.1-201 | ENST00000612827 | 205 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC039056.2-201 | ENST00000622261 | 511 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068631.1-221 | ENST00000626006 | 592 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBE2E2-207 | ENST00000628311 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCLO-206 | ENST00000437081 | 3786 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LRRC39-201 | ENST00000342895 | 1881 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RIOK3P1-201 | ENST00000418778 | 1528 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CDC27-207 | ENST00000531206 | 3177 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MUC7-203 | ENST00000456088 | 2479 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DOCK7-202 | ENST00000340370 | 6731 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPRC6A-202 | ENST00000368549 | 2622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCAT4-201 | ENST00000504263 | 2091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.22-201 | ENST00000362492 | 102 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |