Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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ITGB3BPQ13352 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGB3BPQ13352 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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