Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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