Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CHAF1BQ13112 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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