Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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