Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PRDM2Q13029 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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