Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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