Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms