Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms