Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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RNF20Q5VTR2 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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RNF20Q5VTR2 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RNF20Q5VTR2 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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